Đang khi chạy thử máy trong biển nội địa Seto vào ngày 14 tháng 7, 1943, I-179 mắc tai nạn và đắm với tổn thất nhân mạng toàn bộ 85 sĩ quan và thủy thủ trên tàu.[6] Xác tàu đắm của nó được khám phá bốn ngày sau đó ở độ sâu 81 mét (265 ft), tại tọa độ 32°29′B 131°54′T / 32,483°B 131,9°T / 32.483; -131.900, với nhiều cửa nắp và van thùng dằn phía mũi được mở.[6] Tên nó được cho rút khỏi danh sách đăng bạ hải quân vào ngày 15 tháng 4, 1944.[5][6] Xác tàu đắm được trục vớt từ tháng 4, 1956 đến tháng 3, 1957, rồi tháo dỡ tại Kure.[5][6]